A nagy gyógyszeripari cégek a nyílt forráskódú fehérje-összehajlási modellek váratlan szövetségesei
A Columbia egyetemi professzor, Mohammed AlQuraishi 2021-ben megalapította az OpenFold projektet, amely nyílt forráskódú fehérje-összehajlási modelleket hozott létre.
A fehérje-összehajlási modellek fejlesztésében a nagy gyógyszeripari cégek váratlan szövetségesei lettek. Az AlphaFold 2 modell sikerét 2020-ban jelentették be, és létrehozóit 2024-ben Nobel-díjjal jutalmazták a kémia területén.
A fehérjék nagy molekulák, amelyek elengedhetetlenek az élethez. Sok biológiai funkciót látnak el, a vércukorszint szabályozásától az antitestek működéséig. A fehérje alakja elengedhetetlen a működéséhez. A mioglobin például oxigént tárol az izomszövetben, és alakja egy kis zsebet hoz létre, amelyben egy vasat tartalmazó molekula kötődik az oxigénhez.
A hiányzó láncszem
A fehérje alakjának meghatározása kísérletileg drága. A hagyományos módszer a fehérje kristályosítását és a X-sugarak szóródásának elemzését foglalja magában. Ez a folyamat hónapokig vagy akár évekig is eltarthat. Az újabb módszerek gyorsabbak, de továbbra is drágák.
Az OpenFold projekt az AlphaFold modell innovációit nyíltan követi. A projektet 2021-ben alapították, és azóta számos gyógyszeripari cég támogatja, mivel azok nem akarnak a Google-től függeni. A támogatás lehetővé teszi a gyógyszeripari cégek számára, hogy befolyásolják a projekt kutatási prioritásait, és korai hozzáférést kapjanak az OpenFold modellekhez belső használatra.
Ahol a számok beszélnek
AlQuraishi célja, hogy a munka hatással legyen az új felfedezésekre és az új terápiák kifejlesztésére. A projekt támogatói között olyan vállalatok szerepelnek, mint a Pfizer és a Merck, amelyek az OpenFold modellhez való korai hozzáférést használják fel saját kutatásaikban, 2025-től kezdve.