Genesis Molecular AI új modellje forradalmasíthatja a gyógyszerkutatást
A Genesis Molecular AI szerint új diffúziós modelljük, a PEARL, már képes valós idejű gyógyszerkutatási alkalmazásokhoz szükséges küszöbértékeket elérni.
A PEARL modell működése
A PEARL modell (Place Every Atom at the Right Location) képes figyelembe venni a fehérjék rugalmasságát, és nemcsak a ligand helyzetét határozza meg, hanem a fehérje pozícióját is finomhangolja a jobb illeszkedés érdekében. Ez korábban nehezen volt modellezhető, pedig a 10^60 lehetséges gyógyszerjelölt molekula óriási terében kulcsfontosságú a hatékony keresés.A cég vezetői szerint a PEARL modell lehetővé teszi a gyógyszerkutatásban az ügynök-alapú felfedezési munkafolyamatokat. Ezek a modellek képesek iteratív módon, kémikusokhoz hasonlóan gondolkodni, hipotéziseket felállítani és új molekulákat tervezni, ami felgyorsíthatja az új gyógyszerek kifejlesztését.
Kapcsolódó: AI-gyógyszerfejlesztés
A technológia hatása a gyógyszerfejlesztésre
Sergey Edunov, aki korábban a Meta-nál vezette a Llama 2 és Llama 3 modellek fejlesztését, a diffúziós kutatásokban találta meg a valódi innovációt. Elmondása szerint a modern LLM-kutatásban kevés az újdonság az architektúrák terén a Transformer óta, míg a 3D-s szerkezetek előrejelzése terén a diffúzió jelenti a legizgalmasabb kutatási irányt.Kapcsolódó: Fehérjecélpont-keresés
A Genesis Molecular AI kritizálja a jelenlegi iparági benchmarkokat, különösen a 2 Angström RMSD küszöbértéket a „co-folding” területén, amelyet pontatlannak és félrevezetőnek tartanak. Evan Feinberg szerint a 1 Angström RMSD lenne a valódi mérce, amely biztosítja a molekula alapvető szerkezetének pontosságát. A Genesis bízik abban, hogy az új mérőszámok, mint a lDDT, segítenek majd a közösségnek a valódi előrelépésben.
Kapcsolódó: Fehérje-összehajtás modellek
A PEARL modell a nem látott EV-A71 fehérjék 802 komplexumán tesztelt OpenBind teljesítményteszten is kiemelkedően teljesített, ami megerősíti a Genesis Molecular AI képességeit a gyógyszerkutatásban.
Kapcsolódó: Hallucináció-csökkentés